随着菲律宾国内疫情的缓解，5月16日，菲律宾政府对全国的隔离政策作出调整，并发布了新的指导方针。在5月15日，政府跨部门防疫工作组举行的第37次会议上，新的指导方针获得通过。根据新的指导方针，菲律宾的隔离政策分为4个类别：强化社区隔离、改进型强化社区隔离、一般社区隔离、改进型一般社区隔离。

在包括首都大马尼拉地区在内的吕宋岛多个省市，菲政府对已实行了两个月的“强化社区隔离”政策作出调整，从16日开始实行“改进版强化社区隔离”政策，直至5月31日。这些省市包括首都大马尼拉地区、佩特罗斯市、巴丹省、布拉干省、新怡诗夏省、邦板牙省、三描礼士省、安赫莱斯市及拉古纳省等。

根据调整后的“改进版强化社区隔离”政策要求，在有限制的前提下人们可获得基本服务和重新开始上班；逐步重新开放经济，部分工厂被允许开放至最大产能的50％；国内航班仍然禁止运营，但是准许国际航班有限运营；各级学校继续停课；民众可以进行有限的户外锻炼，但需要遵守安全规定，戴口罩并且与他人保持至少2米以上的社交距离；商场逐步恢复运营，但要执行严格的卫生标准等。

新的政策实施后，16日，菲律宾各地大量人员陆续返回首都大马尼拉地区，造成进入首都地区的公路堵塞。首都地区部分商场也恢复了必要和非休闲的服务。

此外，在宿务市和曼达韦市等疫情仍然十分严峻的地区，将继续维持严格的“强化社区隔离”政策。其余疫情较轻的地区开始实行一般社区隔离政策和改进型一般社区隔离政策。

截至16日，菲律宾新冠肺炎确诊病例累计达12305例，其中死亡817例。